Ban Đảm bảo chất lượng và pháp chế được thành lập theo quyết định số  4100/ QĐ-HVN ngày 15 tháng 08 năm 2025, lịch sử hình thành là sự kết hợp giữa Ban Đảm bảo chất lượng và Ban thanh tra. Hai đơn vị đã trải qua quá trình hình thành như sau:

1. Trung tâm Khảo thí và Đảm bảo chất lượng được thành lập theo Quyết định số 377/QĐ-NN1 ngày 12 tháng 02 năm 2007 của Hiệu trưởng Trường Đại học Nông nghiệp Hà Nội với chức năng tham mưu cho Hiệu trưởng và chịu trách nhiệm tổ chức triển khai và quản lý công tác khảo thí và đảm bảo chất lượng đại học, sau đại học, dịch vụ liên quan đến công tác khảo thí và đảm bảo chất lượng.

Theo Quyết định số 1424/QĐ-NNH ngày 06 tháng 10 năm 2009 Trung tâm được đổi tên thành phòng Khảo thí và Đảm bảo chất lượng chịu sự quản lý hành chính 2 cấp: Trường – Phòng ban.

Ngày 14 tháng 02 năm 2012 Hiệu trưởng ban hành Quyết định số 248/QĐ-NNH thành lập Phòng Thanh tra, Khảo thí và Đảm bảo chất lượng trên cơ sở sáp nhập Ban Thanh tra giáo dục và Phòng Khảo thí & Đảm bảo chất lượng.

Đứng trước yêu cầu ngày càng cao của công cuộc hội nhập giáo dục và yêu cầu chất lượng nguồn nhân lực trình độ cao của đất nước, đòi hỏi phải tiếp tục đẩy mạnh, phát huy hơn nữa các thành tựu chất lượng đào tạo mà Nhà trường đã kiên trì theo đuổi gần 60 năm qua. Việc thành lập một đơn vị chuyên trách để tham mưu và tổ chức triển khai thực hiện các công việc của công tác đảm bảo chất lượng là rất quan trọng và cần thiết. Do đó, ngày 20 tháng 11 năm 2013 Hiệu trưởng Trường Đại học Nông nghiệp Hà Nội đã ban hành Quyết định số 2449/QĐ-NNH thành lập Trung tâm Đảm bảo chất lượng.

2. Ban thanh tra Giáo dục được thành lập theo quyết định số 1178/QĐ-NN1 ngày 23 tháng 10 năm 2007 của Hiệu trưởng Trường Đại học Nông nghiệp Hà Nội với chức năng tư vấn cho Hiệu trưởng về công tác quản lý đào tạo, lao động sư phạm của viên chức giảng dạy công nhân viên, thanh tra khiếu nại, tố cáo về giáo dục và đào tạo trong nhà trường.

Theo định hướng phát triển triển của nhà trường, Hiệu trưởng ban hành quyết định số 248/QĐ-NNH ngày 14 tháng 02 năm 2012 thành lập Phòng Thanh tra, Khảo thí và Đảm bảo chất lượng trên cơ sở sáp nhập Ban Thanh tra giáo dục và Phòng Khảo thí và Đảm bảo chất lượng. Phòng Thanh tra, Khảo thí và Đảm bảo chất lượng chịu sự quản lý hành chính 2 cấp: Học viện – Phòng ban.

Theo quyết định số 1783/QĐ-HVN ngày 26 tháng 08 năm 2014 của Giám đốc Học viện Nông nghiệp Việt Nam, Phòng Thanh tra và Khảo thí được đổi tên thành Ban Thanh tra trực thuộc Học viện Nông nghiệp Việt Nam.